La historia de Tora-Dora comienza cuando el protagonista masculino, Takasu Ryuuji, entra al Segundo Ano del Bachillerato. Bajo la apriencia de una persona poco comunicativa e intimidante, se esconde una personalidad amable y gentil, que es atormentada por su apariencia, especificamente por los ojos de asesino que heredo de su difunto padre. Este rasgo facial le impedira sacar a relucir su verdadera personalidad, por lo cual esta poco esperanzado en conseguir una novia pronto.
Al llegar a su primer dia de escuela, se da con la sorpresa de que esta en la misma clase que su mejor amigo, Kitamura Yusuke, y la chica de la cual esta enamorado, Kushieda Minori. Sin embargo, tras un incidente poco afortunado, tropieza con la llamada "la fiera mas peligrosa de la escuela", Aisaka Taiga, la cual, por casualidades de la vida, tambien esta en su misma clase y es ademas la mejor amiga de Minori.